土地所有权制度是影响农民权益保障和农村可持续发展的核心要素之一。在中国，土地所有权分为国家所有和集体所有两种形式。其中，耕地、林地等农用地的所有权主要由集体经济组织代表全体成员行使。这一制度的合理性和有效性在很大程度上决定了农民的财产权益能否得到充分保护，以及农村地区是否能够实现长期稳定发展。

首先，土地所有权制度直接关系到农民的土地使用权。根据《中华人民共和国宪法》第十条规定：“城市的土地属于国家所有。农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于集体所有；宅基地和自留地、自留山，也属于集体所有。”这意味着大多数情况下，农民并不享有其耕种土地的所有权，而是通过承包经营的方式获得土地的使用权。这种模式虽然有助于提高土地利用效率，但也可能限制了农民对其所依赖的生产资料的控制能力。因此，如何在保证土地所有权稳定的同时，赋予农民更多土地使用权的自由度和灵活性，是一个亟待解决的问题。

其次，土地所有权制度还影响到农民的收益分配权。在实践中，由于土地流转、征地补偿等原因，农民可能会因为土地所有权的不确定性而遭受经济损失。例如，在一些地方，政府为了公共利益的需要会征收农民的土地，但有时补偿标准过低或者分配不公，导致农民无法分享到土地增值带来的收益。此外，随着城镇化进程加快，城镇周边地区的土地价值不断上升，这也使得部分农民面临着被边缘化的风险。因此，如何建立公平合理的土地征用补偿机制，确保农民在土地交易中获得应有的回报，是维护农民权益的关键环节。

再者，土地所有权制度还对农民的社会保障有着重要影响。许多农民将土地视为生存的基础和社会保险的重要来源。如果土地所有权不稳定或得不到有效保护，那么农民就难以依靠土地维持生计并应对生活中的不确定因素。特别是在老龄化背景下，如果没有健全的土地继承和转让规则，老年农民可能会面临失去土地后生活无着的困境。因此，制定和完善与土地所有权相配套的社会保障政策显得尤为迫切。

最后，土地所有权制度还需要考虑到农村地区的可持续发展目标。一方面，要鼓励和支持农业科技创新，推动绿色农业发展，这需要良好的土地产权环境作为支撑；另一方面，要尊重自然生态系统的完整性，避免过度开发造成资源枯竭和环境破坏。这就要求我们在调整土地所有权结构时不仅要考虑经济效益最大化，还要兼顾生态环境保护和区域发展平衡。

综上所述，土地所有权制度对农民权益保障和农村可持续发展具有深远意义。未来应进一步深化改革，完善法律法规体系，探索更加科学有效的土地管理制度，以期达到既保护农民合法权益又能促进农村社会经济发展双赢的目标。