在当今知识经济蓬勃发展的时代，知识产权作为一种无形资产，其重要性日益凸显。然而，随着创新活动的增加，知识产权所有权纠纷在司法实践中屡见不鲜。这类纠纷的复杂性不仅在于法律条文的适用，更在于事实认定的难度和技术细节的考量。

首先，知识产权所有权纠纷的难点之一在于权利归属的认定。在合作开发或职务发明等情况下，各方对知识产权的归属可能存在不同的理解。例如，在企业与员工之间，若员工在职期间完成了某项发明，但未明确约定该发明的归属，则可能引发纠纷。司法实践中，法院需综合考虑劳动合同、企业规章制度以及实际研发过程等因素，以确定权利归属。

其次，证据的收集与认定也是一大挑战。知识产权纠纷往往涉及技术细节，权利人需提供充分证据证明其对某项知识产权享有权利。然而，技术文档、研发记录等证据可能分散于不同部门或人员手中，收集难度较大。此外，电子证据的易篡改性也为证据认定增加了难度。法院在审理此类案件时，需借助技术专家或鉴定机构的意见，以确保判断的准确性。

面对这些难点，司法实践中的应对策略显得尤为重要。首先，完善合同管理是预防纠纷的关键。各方在合作之初应明确约定知识产权的归属及使用范围，避免日后纷争。企业应建立健全知识产权管理制度，对研发过程进行详细记录，确保有据可查。

其次，加强证据保全意识也是重要策略之一。权利人应在研发过程中注意保存相关技术文档、实验记录等证据，并尽可能采用可靠的电子存证技术，以提高证据的可信度。此外，在纠纷发生后，及时申请法院进行证据保全，防止证据灭失或被篡改。

最后，司法机关应加强专业培训，提升法官和技术人员在知识产权领域的专业素养。通过引入技术专家陪审制度，借助外脑提高技术事实认定的准确性。同时，建立多元化纠纷解决机制，鼓励当事人通过调解、仲裁等方式解决争议，以减轻司法负担。

总之，司法实践中的知识产权所有权纠纷因其复杂的权利归属和证据认定问题，给各方带来了诸多挑战。通过完善合同管理、加强证据保全和提升司法专业素养等策略，可以有效应对这些挑战，实现知识产权的依法保护，促进创新活动的持续发展。司法机关、企业和个人需共同努力，构建和谐有序的知识产权保护环境。